开题报告内容：（包括拟研究或解决的问题、采用的研究手段及文献综述，不少于2000字）
动脉粥样硬化风险基因三甲胺裂解酶的同源模建与活性检验
1344102 刁凯
一、研究背景
进入新世纪，中国越来越多的人患上了动脉粥样硬化。该疾病多见于中老年人，且患病群体愈发年轻。根据对各地动粥患者的情况调查显示：动脉粥样硬化患者年龄最小为16岁，大多数在20～30岁，男性比女性高5倍。这表明中国动脉粥样硬化的发病率不断上升。迄今为止，其发病的机制以及相关通路尚未研究清晰，因而临床治疗尚无有效且特异性强的药物。
二、研究目的及内容
我们计划通过相关软件模拟生物大分子，将特性与蛋白质的三级结构进行关联，从分子水平理解蛋白质与底物之间的相互作用。对蛋白质的活性位点（active site）进行推测，研究分子对接。通过已有三甲胺裂解酶的晶体结构对相似序列进行同源模建，研究不同肠道菌株对食物中胆碱及胆碱类似物的裂解酶活性，利用生物信息学的手段，在计算机模拟的基础上进行分子对接和反应结果分析，为今后的临床研究提供参考依据。
三、文献综述
[摘要]：肠道菌群可将红肉、贝类和蛋类中常见的胆碱、左旋肉毒碱、gamma;丁酰甜菜碱进行代谢，产生小分子三甲胺（TMA），TMA又会在人体内肝脏肝黄素单氧酶（Flavin-monooxygenases, FMO3）的作用下变成氧化三甲胺（Trimethylamine-N-oxide, TMAO）。研究证明，在小鼠上发现动脉粥样硬化斑块的面积与血浆TMAO含量正相关。本研究将通过已有三甲胺裂解酶的晶体结构对相似序列进行同源模建，研究不同肠道菌株对食物中胆碱及胆碱类似物的裂解酶活性。
[关键词]：肠道菌群；三甲胺裂解酶；氧化三甲胺；同源模建；分子对接
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