东方蝾螈精子发生期精巢的转录组测序及比较分析文献综述

 2022-08-07 10:08

东方蝾螈精子发生期精巢的转录组测序及比较分析

摘要:转录组所代表的是细胞或组织内全部RNA转录本,它反映着不同的生命阶段、不同的组织类型、不同的生理状态、以及不同的环境条件下表达的基因。转录组测序就是利用生物细胞在某一状态下所能转录出来的所有RNA的总和,包括 mRNA和非编码RNA,将它们反转录为cDNA,然后进行高通量测序来确定该状态下的生物细胞的转录组表达情况。转录组的研究可以从整体水平上反映出细胞中基因的表达情况及其调控规律。而伴随高通量测序技术的快速发展,转录组测序技术已经开始在各个研究领域得到了广泛的应用。本文将从转录组测序技术介绍、国内外研究现状、转录组测序技术在动物上的应用以及转录组测序技术的展望几方面展开论述。

关键词:转录组测序、探究、应用、发展

  1. 文献综述

引言

随着人类基因组计划的完成,人类探究生物的奥秘开始进入了后基因组时代。转录组学、蛋白质组学和基因组学等组学逐渐被广泛应用,其中转录组学和蛋白质组学又是应用最为广泛的,两者之中转录组学又较蛋白质组学率先发展起来,它不仅是研究细胞表型和功能的重要手段,还是研究基因结构、基因功能以及基因表达的新的研究方法[1]

我们可以通过转录组测序得到以下内容: 获得物种或者组织的转录本信息; 得到转录本上基因的相关信息,如:基因结构,功能等;发现新的基因; 基因结构优化; 发现可变剪切;发现基因融合;基因表达差异分析。而其中我们本次试验所期望完成的就是发现新的基因以及基因表达差异分析。

(一)转录组测序技术介绍

转录组测序就是利用生物细胞在某一状态下所能转录出来的所有RNA的总和,包括 mRNA和非编码RNA,将它们反转录为cDNA,然后进行高通量测序来确定该状态下的生物细胞的转录组表达情况。

现阶段的转录组测序应用包括转录本结构研究、转录本结构变异研究、,基因表达水平研究、非编码区域功能研究、低丰度全新转录本发现等[2]。根据不同的研究目的,转录组测试相关的分析方法和流程不尽相同,需要研究者根据实际情况,选择适宜的分析方法来开展研究工作。

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